Важные даты

Даты проведения: 25—27 октября 2016

Место проведения: Москва, ул. Нижняя Сыромятническая, д. 10, стр. 12, 5 этаж — учебный центр RMA

Регистрационный взнос

В стоимость участия входят:

FAQ

Это будет повторение школы в Суздале?

Нет, содержание и форма занятий будут совершенно иными. Будет только частичный повтор IonReporter, но с новыми — нашими — данными в качестве примера. Посмотрим, кто аннотирует лучше ;)

Вы опять лекции читать будете? Я хочу своими руками анализ сделать!

Мы тоже хотим, чтобы вы самостоятельно провели анализ, поэтому мы загрузим вас как совместной работой на мастер-классах, так и домашними заданиями. Сначала разберем примеры вместе, а потом вы сами поработаете — с поэтапной проверкой и обсуждением. Лекции в первый день тоже немного почитаем. Но основное слово этой школы — практика.

Я врач, слово «биоинформатика» меня пугает. А можно мне тоже приехать?

Конечно! Наша школа анализа NGS данных посвящена не биоинформатике, а клинической интерпретации. А интерпретация — это как раз то, что постоянно делает врач, складывая единую картину из результатов осмотра пациента и лабораторных анализов. Мы покажем, как с помощью NGS можно дополнить и уточнить картину. О биоинформатике не волнуйтесь, мы покажем только то, что вы сможете повторить на своем рабочем компьютере.

А у вас будет полный курс обо всех геномных браузерах, базах данных X, Y, Z, всех на свете коммерческих программах?

Нет, мы не будем обсуждать ВСЕ возможные варианты аннотации и фильтрации данных. Мы покажем работающий, проверенный алгоритм действий с использованием необходимого минимума общедоступных программ. Мы точно будем учить применять ANNOVAR, VEP, IGV, UCSC, BLAT/BLAST и некоторые другие и, как ни странно, MS Excel. Мы точно НЕ будем использовать платный коммерческий софт и ресурсы, к которым у вас потом не будет доступа.

А вы расскажите, как выбрать Alligner и понять, какой Varian Caller лучше?

Холивары про варианты bowtie — не наш формат. Эти вопросы будут частично затронуты в лекциях, например, про результаты сравнения пайплайнов в рамках PrecisionFDA.

А без компьютера можно приехать?

Можно, но это все равно что без фонендоскопа в палату войти. Важно, чтобы вы могли научиться проводить анализ на своем собственном компьютере.

А видео как в Суздале будет?

Нет, видеотрансляции школы не будет. Школа вообще не будет записываться на видео для публичного доступа. Но мы сделаем небольшой видео отчёт и фотографии по завершению школы.