Место проведения: Москва, ул. Нижняя Сыромятническая, д. 10, стр. 12, 5 этаж — учебный центр RMA
В стоимость участия входят:
Нет, содержание и форма занятий будут совершенно иными. Будет только частичный повтор IonReporter, но с новыми — нашими — данными в качестве примера. Посмотрим, кто аннотирует лучше ;)
Мы тоже хотим, чтобы вы самостоятельно провели анализ, поэтому мы загрузим вас как совместной работой на мастер-классах, так и домашними заданиями. Сначала разберем примеры вместе, а потом вы сами поработаете — с поэтапной проверкой и обсуждением. Лекции в первый день тоже немного почитаем. Но основное слово этой школы — практика.
Конечно! Наша школа анализа NGS данных посвящена не биоинформатике, а клинической интерпретации. А интерпретация — это как раз то, что постоянно делает врач, складывая единую картину из результатов осмотра пациента и лабораторных анализов. Мы покажем, как с помощью NGS можно дополнить и уточнить картину. О биоинформатике не волнуйтесь, мы покажем только то, что вы сможете повторить на своем рабочем компьютере.
Нет, мы не будем обсуждать ВСЕ возможные варианты аннотации и фильтрации данных. Мы покажем работающий, проверенный алгоритм действий с использованием необходимого минимума общедоступных программ. Мы точно будем учить применять ANNOVAR, VEP, IGV, UCSC, BLAT/BLAST и некоторые другие и, как ни странно, MS Excel. Мы точно НЕ будем использовать платный коммерческий софт и ресурсы, к которым у вас потом не будет доступа.
Холивары про варианты bowtie — не наш формат. Эти вопросы будут частично затронуты в лекциях, например, про результаты сравнения пайплайнов в рамках PrecisionFDA.
Можно, но это все равно что без фонендоскопа в палату войти. Важно, чтобы вы могли научиться проводить анализ на своем собственном компьютере.
Нет, видеотрансляции школы не будет. Школа вообще не будет записываться на видео для публичного доступа. Но мы сделаем небольшой видео отчёт и фотографии по завершению школы.