6 ноября, понедельник
| 09:00 - 09:30 | Регистрация, проверка готовности участников | ||
| 09:30 - 09:40 | Открытие школы | ||
| 09:40 - 10:25 | Применение NGS технологий в медицинской генетике. Эффективность. Ограничения | Михаил Скоблов | |
| 10:25 - 11:10 | Платформы для секвенирования. Приборы, наборы и софт | Александр Лавров | |
| 11:10 - 11:30 | Кофе-брейк | ||
| 11:30 - 12:10 | Обзор инструментов и сценариев по процессингу NGS данных из FASTQ в BAM и VCF |
Руслан Абасов |
|
| 12:10 - 12:20 | Перерыв | ||
| 12:20 - 13:00 | Структура VCF файла. Аннотация вариантов нуклеотидной последовательности |
Руслан Абасов |
|
| 13:00 - 14:00 | Обед | ||
| 14:00 - 14:50 | Номенклатура названий патогенных вариантов в соответствии с правилами HGVS. Использование геномных браузеров | Михаил Скоблов | |
| 14:50 - 15:00 | Перерыв | ||
| 15:00 - 15:50 | Патогенные варианты: нонсенс, инделы, миссенс, сплайсинговые, синонимичные. Молекулярные механизы их действия. Оценка функциональной значимости | Михаил Скоблов | |
| 15:50 - 16:10 | Кофе-брейк | ||
| 16:10 - 17:00 | Критерии оценки патогенности вариантов нуклеотидной последовательности. Освоение навыков работы с БД. Оценка патогенности герминальных вариантов нуклеотидной последовательности, работа с базами данных на примере наследственных опухолевых синдромов | Петр Спарбер | |
| 17:00 - 17:10 | Перерыв | ||
| 17:10 - 18:00 | Практическая работа по оценке патогенности SNV | Петр Спарбер | |
7 ноября, вторник
| 09:00 - 09:30 |
Разбор домашнего задания |
||
| 09:30 - 10:10 |
Современная онкогенетика: диагностика наследственных онкологических синдромов |
Дмитрий Михайленко | |
| 10:10 - 10:15 |
Перерыв |
||
| 10:15 - 10:55 | Современная онкогенетика: профилирование соматических мутаций в опухолях | Дмитрий Михайленко | |
| 10:55 - 11:15 | Кофе-брейк | ||
| 11:15 - 12:00 | Мастер-класс по работе с IGV браузером | Александр Лавров | |
| 12:00 - 12:10 | Перерыв | ||
| 12:10 - 13:00 | Мастер-класс по интерпретации данных секвенирования генов BRCA1/2 в опухолевых образцах рака яичника и РМЖ |
Анастасия Жевлова |
|
| 13:00 - 14:00 |
Обед |
||
| 14:00 - 14:40 |
Мастер-класс по интерпретации данных секвенирования генов BRCA1/2 в опухолевых образцах рака яичника и РМЖ |
Анастасия Жевлова |
|
| 14:40 - 14:45 |
Перерыв |
||
| 14:45 - 15:25 |
Мастер-класс по интерпретации данных секвенирования генов BRCA1/2 в опухолевых образцах рака яичника и РМЖ |
Анастасия Жевлова |
|
| 15:25 - 15:30 | Перерыв | ||
| 15:30 - 16:00 |
Практическая работа: небольшие таргетные панели в диагностике моногенных нозологий |
Владимир Стрельников |
|
| 16:00 - 16:20 | Кофе-брейк | ||
| 16:20 - 17:05 |
Практическая работа: дифференциальная диагностика светлоклеточного рака почки |
Владимир Стрельников |
|
| 17:05 - 17:15 | Перерыв | ||
| 17:15 - 18:00 |
Практическая работа: коммерческие панели Cancer Hotspot Panel и Comprehensive Cancer Panel, разбор случаев |
Владимир Стрельников |
|
| 18:00 - | Networking drink | ||
8 ноября, среда
|
09:00 - 09:30 |
Разбор домашнего задания |
||
| 09:30 - 10:10 |
Разбор клинических случаев проведения BRCA1/2 тестирования для пациентов с раком молочной железы, яичников, поджелудочной железы и простаты |
Алексей Баринов | |
| 10:10 - 10:20 | Перерыв | ||
| 10:20 - 11:00 |
Разбор клинических случаев проведения BRCA1/2 тестирования для пациентов с раком молочной железы, яичников, поджелудочной железы и простаты |
Алексей Баринов |
|
| 11:00 - 11:20 | Кофе-брейк | ||
| 11:20 - 12:05 |
Разбор клинических случаев синдрома Линча и полипозных синдромов рака тостой кишки на примере данных полноэкзомного секвенирования |
Алексей Баринов |
|
| 12:05 - 12:15 | Перерыв | ||
| 12:15 - 13:00 |
Инструменты для интерпретации вариантов: COSMIC, OncoKB, и другие |
Валентина Якушина |
|
| 13:00 - 14:00 | Обед | ||
| 14:00 - 14:50 |
Мастер-класс по анализу случаев рака щитовидной железы |
Валентина Якушина |
|
| 14:50 - 15:00 | Перерыв | ||
| 15:00 - 15:50 |
Анализ данных и интерпретация соматических мутации опухолевой ткани с точки зрения назначения таргетной терапии. Поиск и анализ научной литературы, формирование отчета |
Юлия Жусина |
|
| 15:50 - 16:10 | Кофе-брейк | ||
| 16:10 - 17:00 |
Анализ данных и интерпретация соматических мутации опухолевой ткани с точки зрения назначения таргетной терапии. Поиск и анализ научной литературы, формирование отчета |
Юлия Жусина |
|
| 17:00 - 17:10 | Перерыв | ||
| 17:10 - 18:00 |
Анализ данных и интерпретация соматических мутации опухолевой ткани с точки зрения назначения таргетной терапии. Поиск и анализ научной литературы, формирование отчета |
Юлия Жусина |
|
9 ноября, четверг
| 09:00 - 09:45 |
Соматическое секвенирование в детской онкологии. Типы выявляемых биомаркеров. Составление заключения |
Александр Друй |
|
| 09:45 - 09:50 | Перерыв | ||
| 09:50 - 10:30 |
Мастер-класс по интерпретации данных секвенирования при опухолях детского возраста 1 |
Александр Друй |
|
| 10:30 - 10:50 | Кофе-брейк | ||
| 10:50 - 11:40 |
Мастер-класс по интерпретации данных секвенирования при опухолях детского возраста 2 |
Александр Друй | |
| 11:40 - 11:50 | Перерыв | ||
| 11:50 - 12:40 |
Мастер-класс по анализу NGS-данных при различных солидных опухолях у детей с подозрением на наследственный генетический синдром 1 |
Мария Курникова/Людмила Ясько |
|
| 12:40 - 13:40 | Обед | ||
| 13:40 - 14:35 |
Мастер-класс по анализу NGS-данных при различных солидных опухолях у детей с подозрением на наследственный генетический синдром 2 |
Мария Курникова/Людмила Ясько |
|
| 14:35 - 14:45 | Перерыв | ||
| 14:45 - 15:40 |
Работа с герминальными вариантами, выявляемыми при секвенировании ткани опухоли |
Мария Курникова/Людмила Ясько/Александр Друй |
|
| 15:40 - 16:00 | Кофе-брейк | ||
| 16:00 - 16:55 |
Поиск соматических мутаций при солидных опухолях у взрослых. Широкие таргетные панели (300-700 генов). "Краегуольные подводные камни": пробоподготовка, биоинформатика, интерпретация, взаимодействие внутри мультидисциплинарной команды |
Андрей Зарецкий |
|
| 17:00 - 17:10 | Перерыв | ||
| 17:10 - 18:00 |
Дифференциальная диагностика меланом и невусов кожи и внутренних органов |
Андрей Зарецкий |
|
10 ноября, пятница
|
09:00 - 09:30 |
Разбор домашнего задания |
||
| 09:30 - 10:30 | Использование технологии секвенирования нового поколения (NGS) в современной онкологии: варианты и возможности | Евгений Денисов | |
| 10:30 - 10:40 | Перерыв | ||
| 10:40 - 11:10 | Мастер-класс по анализу мутаций в генах гомологичной рекомбинации при раке предстательной железы, и яичников. | Татьяна Кекеева | |
| 11:10 - 11:30 | Кофе-брейк | ||
| 11:30 - 12:40 | Мастер-класс по анализу мутаций в генах гомологичной рекомбинации и их биаллельной инактивации | Татьяна Кекеева | |
| 12:40 - 12:50 | Вопросы-ответы |
|
|
| 12:50 - 13:50 | Обед | ||
| 13:50 - 16:50 | Экзамен | ||
| 16:50 - 17:30 | Фруктовый фрэш во время проверки экзаменационных работ | ||
| 17:30 - 18:00 | Разбор экзаменационных заданий. Выдача сертификатов. Закрытие | ||
